高分文章和面上项目最常见的五种模式,你都知道吗?
今天我们来分享一个压箱底的干货:高分(10+)文章和面上项目中最常见的5种模式,以为大家设计课题或者准备基金提供启发。
一、上下游;
二、双头蛇;
三、成环路;
四、做对话;
五、调平衡。
一、上下游
这个模式是大家见的最多的,这个模式就是以主要创新点C为中心,分别揭示上游的条件A和因素B对A的调控,以及C对靶基因D和通路E的调节。以大家最为熟悉的microRNA为例,以前多数研究的主题是:新microRNA C通过靶基因D调控E通路在XXX疾病中的功能和机制,主要是做下游的C-D-E;现在大家已经慢慢把研究重点放到上游上来,即条件A与因素B,即在某个条件(比如缺氧)下因素B(比如转录因子或者lncRNA)调节新microRNA C的表达。一般来说,根据研究顺序,一般有三种阐述模式,我们在文章里面都能看到:
(1)先做C,再分别往上游和下游展开;
(2)先做E和D,一直往上游做,先确定D被C调控,再做C被B在A条件下调控;
(3)先联系条件A和E通路,再补齐B-C-D。
二、双头蛇
这个模式用具俗语说就是:花开两朵,各表一枝。即:创新点A分别通过两种方式发挥功能,这里的不同方式可以是两个靶基因和通路,也可以是两个表型,也可以是两种细胞,甚至是组合起来,通过不同的通路影响不同细胞的不同表型,但是最终影响的疾病特征是一个,比如某个microRNA不仅可以通过调控snail基因表达影响肿瘤细胞EMT,还可以通过调控微环境中CAF细胞分泌VEGF影响血管生成,不过最终影响的都是肿瘤的转移过程。当然,还有一个双头蛇模式的镜像,即创新点分子A被不同的两种因素所调控,这两种因素都可以独立调控因素A。
三、成环路
这个模式就更好理解了,就是俗话说的“冤冤相报何时了”,信号从分子A通过一系列信号B-C-D……X再回到A,形成所谓的“反馈回路”或者环路,如果是正反馈回路,信号就在传递过程中被不断放大。还是以microRNA为例,比如microRNA A通过靶基因B等调控某条通路中X的表达或者活化,而该通路中的X则如何转录调控microRNA A,从而形成microRNA A-靶基因B……-转录因子X-microRNA A的反馈回路。
这个模式是模式一的变种,只是上游和下游形成了重叠和回路,同时也与下面的模式四在某种程度上类似。
四、做对话
这个模式的对话(cross-talk)可以发生在细胞之间,也可以发生在分子和通路之间。即:细胞A通过某种方式影响细胞B,而细胞B以某种(类似或者不同的)方式影响A;也可能出现A-B-C三角恋的关系;还会出现单恋的关系,即细胞A只影响B,而B不影响A(可能未知或者其它原因),最终影响疾病的某个过程。当然,由于涉及到三个因素的对话过于复杂,一般比较常见的是两种细胞或者分子、通路之间的对话。如果只涉及到两类细胞或者分子,模式上就可以归类为模式三了。举例,比如肿瘤微环境中的细胞与肿瘤细胞之间的对话(A-B-A),以及间充质干细胞治疗中与靶细胞的对话(A-B)。
五、调平衡
生命在于运动,生命在于静止,生命在于平衡。
这里的平衡包含的因素太多了,病理与生理的平衡,如氧化-抗氧化的平衡,分子表达的平衡,免疫细胞的平衡等等。在科研里面,我们可以看到由于平衡被破坏,比如ROS产生导致的氧化应激,由内外因素导致的基因可变剪接产物变化导致原先的抑癌基因产物变为癌基因产物,Th17与Treg的平衡等等。
五个模式的基本情况就介绍到这里,大家有没有从中发现你喜欢的电影或者故事的影子?